Биопсия выполняется в ходе проктоскопии. Для этого применяется специальный эндоскоп, который позволяет выполнить забор биоматериала в ходе обследования. Образец опухоли в дальнейшем направляется на исследование, которое выявит или опровергнет наличие патологических клеток, а также покажет гистологическую структуру уплотнения или новообразования. Также биопсия может проводиться без проктоскопии. Это может быть аспирационная тонкоигольная проба либо щипковая, когда небольшой образец отсекается от опухоли механически. Осмотр и забор биоматериала могут проводиться при помощи аноскопа.