Благодаря высокой специфичности, цитологическое исследование используется для определения стадии злокачественных новообразований различных органов, при этом исследуются пунктаты лимфатических узлов. Такой диагностический подход широко применяется при обследовании пациентов с раком кожи, молочной железы, а также печени, почек, легких и других внутренних органов. Специфичность анализа приближается к 100  %.

С помощью различных окрасок в жидкостях, полученных при пункции плевральной, перикардиальной, брюшной, суставной полости, а также при спинномозговой пункции, могут быть выявлены признаки инфекционного процесса и воспаления (нейтрофилы, лимфоциты, бактерии), кровоизлияния (эритроциты), а также признаки атипии, малигнизации и других патологических процессов.

Цитология соскобов эрозий и язв играет ведущую роль в дифференциальной диагностике кожных болезней. Исследование проводят при подозрении на истинную пузырчатку, буллезный пемфигоид, простой герпес, афтозный стоматит и некоторые другие заболевания.

Результат цитологического исследования следует оценивать с учетом дополнительных клинических, инструментальных и лабораторных данных.

Цитологический материал ПЕРВОЙ категории сложности, взятый при профилактических исследованиях у здоровых лиц:

• -соскобы с небных миндалин, влагалищной порции и канала с шейки матки, прямой кишки
• -осадок мочи
• -кольпоцитологический материал в мазках

Исследования: мазок из шейки матки, соскоб из цервикального канала, пайпель-биопсия, пункция заднего свода, мазок (в режим гинекологов, а на Гашека по записи); С конъюктивы глаз (в режим работы офтальмологов, а на Лукашевича по записи); Мазок-отпечаток из отделяемого молочных желез (в режим работы маммолога);  эндоскопический материал. Мазок с конъюктивы на цитологию лучше сдавать в буднии дни.